Chùa Vĩnh Nghiêm được nhân dân tôn vinh làm một trong những "chốn tổ" của dòng thiền Trúc Lâm tam tổ – dòng thiền mang những đặc trưng riêng của Việt Nam.
Chính vì là nơi đào luyện tăng đồ, nên chùa Vĩnh Nghiêm còn là nơi tàng trữ nhiều bộ ván kinh quý giá. Đặc biệt là kho mộc thư với những bộ ván in kinh như: Hoa nghiêm sớ, Di đà sớ, Yên Tử nhật trình, Bản Nguyện Chân kinh,…
Chùa còn giữ được 34 đầu sách với hơn 3.000 bản khắc, mỗi bản có hai mặt, mỗi mặt 2 trang sách khắc ngược (âm bản) bằng chữ Hán Nôm (đọc từ trái sang phải, từ trên xuống dưới) gồm: y học, văn học, bùa chú, luật giới nhà Phật… Bản khắc lớn nhất có chiều dài hơn 1m, rộng 40 – 50 cm, bản nhỏ nhất khoảng 15 x 20 cm…, một số ván in có những hoa văn và hình chạm khắc đặc biệt nhằm thể hiện những ý nghĩa triết lý riêng của đạo Phật.
Trải qua mấy trăm năm, đến nay những mộc bản kinh Phật này được lưu giữ cẩn thận tại chùa và được xem như một báu vật quốc gia, phản ánh những tư tưởng quan trọng trong triết lý Phật giáo Việt Nam.
Nhằm bảo tồn, lưu giữ những giá trị của kho Mộc bản Kinh Phật quý giá này, từ năm 2009, Sở Văn hóa – Thể thao và Du lịch tỉnh Bắc Giang đã tiến hành tổng kiểm kê, đánh số và in dịch toàn bộ số ván kinh trên đồng thời tiến hành lập hồ sơ khoa học đệ trình UNESCO công nhận là di sản tư liệu của thế giới.
